Kao i svi drugi lijekovi tako i lijekovi protiv mučnina i povraćanja mogu uzrokovati i neke nuspojave ili štetne učinke. Različiti lijekovi imaju različite nuspojave, ali isto tako i svaka osoba može drugačije reagirati. Lijekovi koji se primjenjuju u liječenju mučnina i povraćanja ne dovode do ozbiljnijih nuspojava, odnosno štetnih učinaka. Najčešće nuspojave su:

• glavobolja (granisetron, ondansetron, palonosetron, tropisetron, metoklopramid);
   
• zatvor stolice, opstipacija, začep (granisetron, ondansetron, palonosetron i tropisetron);
   
• umor, malaksalost, pospanost (haloperidol, levopromazine, lorazepam);
   
• probavne smetnje, dispepsija (deksametzon);
   
• nesanica, insomnia (deksametazon);
   
• motorni nemir, nevoljne kontrakcije mišića vrata, lica i očnih mišića, otežani voljni pokreti (metoklopramid, uglavnom kod mlađih osoba);
   
• proljevi (metoklopramid);
   
• crvenilo kože i osjećaj topline u koži (ondansetron, tropisetron, deksametazon, kada se daje putem i.v. injekcije).

Moguće su i neke druge, znatno rjeđe nuspojave kao što je suhoća usta, povišenje transaminaza (jetrenih enzima), bol u prsima, dispneja, bronhospazam, aritmija, a iznimno rijetko i kolaps i nesvjestica. Sve su te nuspojave uglavnom blage i prolazne te se mogu lako liječiti. Važno je da na vrijeme o tome obavijestite svog liječnika koji će vas uputiti kako se ponašati i prepisati vam eventualne lijekove za ublažavanje (analgetici, laksativi, lijekovi za zaštitu želučane sluznice).